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SARS-CoV-2의 출현 B.1.1.7 계보

미국, 2020년 12월 29일2021년 1월 12일

Summer E. Galloway, PhD 1 ;Prabasaj Paul, PhD 1 ;Duncan R. MacCannell, PhD 2 ;Michael A. Johansson, PhD 1 ;

존 T. 브룩스, MD 1 ;Adam MacNeil, 박사 1 ;Rachel B. Slayton, PhD 1 ;Suxiang Tong, PhD 1 ;벤자민 J. 실크, 박사 1 ;그레고리 L. 암스트롱, MD 2 ;

매튜 비거스태프, ScD 1 ;Vivien G. Dugan, PhD

2021년 1월 15일에 이 보고서는 MMWR로 게시되었습니다.MMWR 웹사이트(https://www.cdc.gov/mmwr)의 조기 릴리스.

2020년 12월 14일 영국에서 보고된SARS-CoV-2 우려 변종(VOC), 계보 B.1.1.7,VOC 202012/01 또는 20I/501Y.V1이라고도 합니다.*B.1.1.7 변종은 9월에 등장한 것으로 추정됩니다.2020년 빠르게 지배적인 순환이 되었습니다.영국의 SARS-CoV-2 변종(1).B.1.1.7은미국을 포함한 30개국 이상에서 검출되었습니다.처럼2021년 1월 13일 현재 B.1.1.7의 약 76건이 있습니다.미국 12개 주에서 검출되었습니다.여러 줄의 증거B.1.1.7이 B.1.1.7보다 더 효율적으로 전송됨을 나타냅니다.다른 SARS-CoV-2 변종(1삼).모델링 된 궤적미국의 이 변종은 2021년 초에 급속한 성장을 보입니다.3월에 우세한 변종이 됩니다.증가SARS-CoV-2 전파는 긴장된 의료 서비스를 위협할 수 있습니다.확장되고 보다 엄격한 구현이 필요합니다.공중 보건 전략(4)의 비율을 높이고전염병 통제에 필요한 인구 면역.취득전송을 줄이기 위한 조치는 이제 잠재성을 줄일 수 있습니다.B.1.1.7의 영향 및 백신 증가에 중요한 시간 허용적용 범위.총체적으로 향상된 게놈 감시효과적인 대중의 지속적인 준수와 결합예방접종, 물리적 거리두기,마스크 사용, 손 위생, 격리 및 검역,바이러스인 SARS-CoV-2의 확산을 제한하는 데 필수적입니다.코로나바이러스 질병 2019(COVID-19)를 유발합니다.전략적증상은 없으나 감염 위험이 높은 사람에 대한 검사SARS-CoV-2에 노출되었거나대중과의 피할 수 없는 빈번한 접촉은 또 다른지속적인 확산을 제한할 수 있는 기회.

글로벌 게놈 감시 및 신속한 오픈 소스 공유바이러스 게놈 서열의 분석은 거의 실시간으로 가능해졌습니다.진화하는 SARS-CoV-2의 탐지, 비교 및 ​​추적통제하기 위한 공중 보건 노력을 알릴 수 있는 변형감염병 세계적 유행.반면 바이러스 게놈의 일부 돌연변이는출현했다가 후퇴하면, 다른 사람들은 선택적 전진을 부여할 수 있습니다.향상된 전달성을 포함하여 변종에 적용하여이러한 변종은 다른 순환 변종을 빠르게 지배할 수 있습니다.

팬데믹 초기에 SARS-CoV-2 변종은증가하는 스파이크(S) 단백질의 D614G 돌연변이수용체 결합 결합력은 많은지리적 영역(5,6).2020년 늦가을에 여러 국가에서 탐지가 보고되었습니다.보다 효율적으로 확산되는 SARS-CoV-2 변종.게다가B.1.1.7 변형에 대한 주목할만한 변형에는 B.1.351이 포함됩니다.남아프리카에서 처음 발견된 혈통과 최근 확인된B.1.1.28 하위클레이드(이름이 바뀜P.1) 4명의 여행자에게서 검출됨하네다(도쿄) 정기 상영 중 브라질에서공항.§ 이러한 변종은 유전적 muta의 별자리를 가지고 있습니다.S 단백질 수용체 결합 도메인을 포함하여이는 숙주 세포 안지오텐신에 결합하는 데 필수적입니다.바이러스를 촉진하기 위한 효소-2(ACE-2) 수용체 전환기입.증거는 이들에서 발견된 다른 돌연변이가 있음을 시사합니다.변형은 전달 가능성을 높일 수 있을 뿐만 아니라또한 일부 진단 실시간 성능에 영향을 줄 수 있습니다.역전사중합효소 연쇄반응(RT-PCR)분석중화 항체에 대한 감수성을 감소시킵니다.(2,3,510).최근 사례 보고서는 첫 번째 사례를 기록했습니다.브라질에서 SARS-CoV-2 변종으로 SARS-CoV-2 재감염E484K 돌연변이를 포함하는**회복기 혈청 및 단클론에 의한 중화 감소항체 (9,10).

이 보고서는 B.1.1.7 변종의 출현에 중점을 둡니다.미국에서.2021년 1월 12일부로B.1.351 또는 P.1 변종은미국.신종 SARS-CoV-2에 대한 정보우려의 변형, CDC는 전용 웹페이지를 유지 관리합니다.신종 SARS-CoV-2 변종에 대한 정보를 제공합니다.††

 B.1.1.7 계보(20I/501Y.V1)

B.1.1.7 변형은 S 단백질에 돌연변이를 가지고 있습니다.수용체 결합 형태에 영향을 미치는 (N501Y)도메인.이 변종에는 13개의 다른 B.1.1.7 계통 정의 돌연변이(표)가 있으며, 그 중 몇 가지는 S 단백질에 있습니다.위치 69 및 70(del6970) 그다른 SARS-CoV-2 변종에서 자발적으로 진화했으며전달성을 증가시키는 것으로 가정됨(2,7).삭제위치 69 및 70에서 S-유전자 표적 실패(SGTF) 유발적어도 하나의 RT-PCR에서기반 진단 분석(즉,ThermoFisher Taq 경로 COVID-19 분석, B.1.1.7 변종del69를 사용하는 개미 및 기타 변종70 네거티브 생성S-유전자 표적에 대한 결과 및 다른 2개에 대한 양성 결과대상);SGTF는 영국에서 대리인 역할을 했습니다.B.1.1.7 사례 식별용(1).여러 줄의 증거는 B.1.1.7이 더 많다는 것을 나타냅니다.다른 SARS-CoV-2에 비해 효율적으로 전송영국에서 유통되는 변종.영국 지역B.1.1.7 시퀀스의 비율이 높을수록 전염병이 더 빨리 퍼졌습니다.다른 분야보다 성장, SGTF 진단 증가동일한 영역에서 비 SGTF 진단보다 더 빠르고더 높은 비율의 접촉자가 지표 환자에 의해 감염됨에 감염된 지수 환자보다 B.1.1.7 감염다른 변형(1,3).변종 B.1.1.7은 미국 팬을 증가시킬 가능성이 있습니다.앞으로 몇 달 안에 demic 궤적.이 효과를 설명하기 위해,간단한 두 가지 변형 구획 모델이 개발되었습니다.모든 순환 중 B.1.1.7의 현재 미국 유병률바이러스는 알려져 있지 않지만 0.5% 미만인 것으로 생각됩니다.제한된 수의 사례 감지 및 SGTF 데이터(8).을 위한모델, 초기 가정에는 B.1.1.7 유병률이 포함되었습니다.모든 감염 중 0.5%, SARS-CoV-2 면역이전 감염률 10%30%, 시간에 따라 변하는 번식1.1의 수(R t )(완화되지만 전송 증가)또는 현재 변종의 경우 0.9(전파 감소), 1일 100,000명당 60건의 발생률 보고2021년 1월 1일. 이러한 가정은 정확하게 나타내지 않습니다.단일 미국 위치가 아니라 일반화를 나타냅니다.전국적으로 공통된 조건.R t 의 변화획득 면역으로 인한 시간과 preva 증가B.1.1.7의 Lence는 B.1.1.7 R t를 가정하여 모델링되었습니다.현재 변형의 R t 의 1.5배 상수영국의 초기 추정치(1,3).다음으로 예방접종의 잠재적 영향을 모델링했습니다.1인당 100만회 백신을 접종했다고 가정하면2021년 1월 1일부터 95% 면역2회 접종 후 14일 만에 달성되었습니다.구체적으로,현재 변종 또는B.1.1.7 변형이 가정되었지만 효율성 및감염에 대한 보호 기간은 불확실합니다.임상시험의 1차 평가변수가 아니었기 때문입니다.초기 백신용.이 모델에서 B.1.1.7 유병률은 처음에는 낮지만그것은 현재 변종보다 더 전염성이 있으며,2021년 초에 급속한 성장, 우세한 변수가 됨3월 개미(그림 1).전류 전송 여부변형이 증가하거나(초기 R t = 1.1) 천천히 감소합니다.(초기 R t = 0.9) 1월에 B.1.1.7이 상당한 변화를 주도함전송 궤적과 지수의 새로운 단계성장.감염을 예방하는 예방접종으로초기 전염병 궤적은 변하지 않고 B.1.1.7 확산여전히 발생합니다(그림 2).다만, B.1.1.7이 된 후우세한 변종인 경우 전송률이 크게 감소했습니다.백신 접종이 근거리 전파 감소에 미치는 영향기간은 전송이 발생한 시나리오에서 가장 컸습니다.이미 감소하고 있습니다(초기 R t = 0.9)(그림 2).초기 노력범용 및공중 보건 완화 전략 준수 증가,지속적인 예방 접종에 더 많은 시간을 할애하여인구 수준 면역.

논의

현재 임상 결과에 알려진 차이는 없습니다.기술된 SARS-CoV-2 변종과 관련됨;하지만,더 높은 전송률은 더 많은 사례로 이어지고 증가합니다.임상 치료가 필요한 전체 사람의 ​​수, 악화자이미 긴장된 의료 시스템의 부담을 덜어주고,그리고 그 결과 더 많은 사망자가 발생합니다.지속적인 게놈 감시B.1.1.7 사례와 다른 사례의 출현을 식별하기 위해미국에서 우려의 변형은 다음을 위해 중요합니다.코로나19 공중보건 대응.반면 SGTF 결과는확인할 수 있는 잠재적인 B.1.1.7 사례를 식별하는 데 도움이 될 수 있습니다.시퀀싱을 통해 나타나지 않는 우선 변이를 식별합니다.SGTF는 시퀀스 기반 감시에만 의존합니다.

 

 

 

변형 지정

최초 식별  

특징적인 돌연변이

(단백질: 돌연변이)

현재 서열이 확인된 사례 수

국가

시퀀스

위치 날짜 미국 세계적인  
B.1.1.7(20I/501Y.V1) 영국 2020년 9월 ORF1ab: T1001I, A1708D, I2230T,

델36753677 SGF

에스: del6970 HV, del144 Y, N501Y,

A570D, D614G, P681H, T761I,

S982A, D1118H

ORF8: Q27stop, R52I, Y73C

엔: D3L, S235F

76 15,369 36
B.1.351(20H/501Y.V2) 남아프리카 2020년 10월 ORF1ab: K1655N

E: P71L

엔: T205I

S:K417N, E484K, N501Y, D614G,

A701V

0 415 13

 

P.1(20J/501Y.V3 브라질과 일본 2021년 1월 ORF1ab: F681L, I760T, S1188L,

K1795Q, 델36753677 SGF, E5662D

S: L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S,

K417T, E484K, N501Y, D614G,

H655Y, T1027I

ORF3a: C174G

ORF8: E92K

ORF9: Q77E

ORF14: V49L

엔: P80R

0 35 2

 

약어: del = 삭제;E = 외피 단백질;N = 뉴클레오캡시드 단백질;ORF = 오픈 리딩 프레임;S = 스파이크 단백질.

영국 및 B.1.1.7 모델에서의 경험이 보고서에 제시된 영향은 전염성이 더 강합니다.변형은 모집단의 사례 수를 가질 수 있습니다.그만큼이 변종의 전파 가능성을 높이려면 더 많은백신 접종과 mitiga의 엄격한 결합 구현조치(예: 거리두기, 마스크 착용, 손 위생)SARS-CoV-2의 확산을 통제하기 위해.이러한 조치는더 늦기보다 더 빨리 도입되면 더 효과적입니다.B.1.1.7 변종의 초기 확산을 늦추기 위해.에 대한 노력사례의 추가 급증에 대비하여 의료 시스템을 준비하십시오.보증합니다.투과율이 증가한다는 것은 또한 더 높은예방 접종 범위가 예상보다 달성되어야 합니다.대중을 보호하기 위해 동일한 수준의 질병 통제를 달성하십시오.덜 전송 가능한 변종과 비교.학계, 산업계, 주, 영토,부족 및 지역 파트너, CDC 및 기타 연방 기관게놈 감시를 조정하고 강화하고 있으며미국 전역의 바이러스 특성화 노력.질병통제예방센터SARS-CoV-2를 통한 미국 시퀀싱 노력 조정공중 보건 비상 대응을 위한 시퀀싱,역학 및 감시(SPHERES)§§협회,여기에는 약 170개의 참여 기관이 포함되며 SARS-CoV-2의 사용을 촉진하기 위해 개방형 데이터 공유를 촉진합니다.시퀀스 데이터.SARS-CoV-2 바이러스 진화를 추적하기 위해 CDC는이해하기 위해 다각적인 게놈 감시 구현역학적, 면역학적, 진화적 과정바이러스 계통 발생(계통 역학)을 형성합니다.가이드 발발조사;탐지 및 특성화를 용이하게 합니다.재감염 가능성, 백신 돌파 사례,떠오르는 바이러스 변종.2020년 11월 CDC는국립 SARS-CoV-2 변종 감시(NS3) 프로그램국내 SARS-CoV-2 대표성 향상시퀀스.이 프로그램은 64명의 미국 대중과 협력합니다.게놈 감시 시스템을 지원하는 보건 실험실;NS3는 또한 SARS-CoV-2 표본 컬렉션을 구축하고 있습니다.공중 보건 대응 및 과학적 지원을 위한 nd 시퀀스돌연변이에 관한 영향을 평가하기 위한 연구기존 권장 의료 대책.CDC는또한 여러 대형 상업 임상 실험실과 계약을 맺었습니다.수만 개의 SARS-CoV-2를 신속하게 시퀀싱하는 토리매달 긍정적인 표본을 수집하고 7개의 학업에 자금을 지원했습니다.협력하여 게놈 감시를 수행하는 기관공중 보건 기관과 함께시기 적절한 게놈 감시 데이터의 가용성미국.이러한 국가적 이니셔티브 외에도많은 주 및 지역 공중 보건 기관에서 시퀀싱하고 있습니다.

그림 1. 현재 SARS-CoV-2 변종과 B.1.1.7 변종의 시뮬레이션 사례 발생 궤적*지역사회 예방접종이 없다고 가정현재 변형에 대한 초기 R t = 1.1(A) 또는 초기 R t = 0.9(B)미국, 1월2021년 4월

 

그림 1
그림 2
약어
그림 1

SARS-CoV-2는 지역 역학을 더 잘 이해하고전염병에 대한 공중 보건 대응을 지원합니다.이 보고서의 결과는 최소한 세 가지 제한이 적용됩니다.스테이션.첫째, 전달력 증가의 크기미국에서 관찰된 것과 비교하여영국은 불분명합니다.둘째, 유병률현재 미국의 B.1.1.7도 알려지지 않았지만변종 탐지 및 유병률 추정이 향상됩니다.미국의 감시 노력이 강화되었습니다.마지막으로 지역 미티가측정값도 매우 가변적이어서RT .여기에 제시된 특정 결과는 시뮬레이션을 기반으로 합니다.1월 1일 이후 완화에 변화가 없다고 가정했습니다.B.1.1.7 변종 전쟁의 전염성 증가공중 보건 전략의 엄격한 이행을 촉구합니다.전송을 줄이고 B.1.1.7의 잠재적 영향을 줄입니다.예방 접종 범위를 늘리기 위해 중요한 시간을 벌 수 있습니다.CDC의모델링 데이터는 준수의 보편적인 사용 및 증가를 보여줍니다.완화 조치와 백신 접종이 중요합니다.새로운 사례와 사망자 수를 크게 줄입니다.앞으로 몇 달.또한, 없는 사람에 대한 전략적 테스트COVID-19 증상이 있지만 다음과 같은 위험이 높은 사람SARS-CoV-2에 감염되면 다음 기회를 제공합니다.지속적인 확산을 제한하십시오.총체적으로 향상된 게놈 감시공중 보건 준수 증가와 결합된 랜스예방 접종, 물리적 거리를 포함한 완화 전략ing, 마스크 사용, 손 위생, 격리 및 검역,SARS-CoV-2의 확산을 제한하는 데 필수적이며공중 보건 보호.

감사의 말

공중 보건 비상사태를 위한 시퀀싱 멤버대응, 역학 및 감시 컨소시엄;주 및 지역공중 보건 실험실;공중 보건 연구소 협회;CDC COVID-19 대응팀;호흡기 바이러스 지점,CDC.Division of Viral Diseases.Committee of Medical Journal Editors 양식의 잠재적 공개이해 상충.잠재적인 이해 상충은 공개되지 않았습니다.

참조

1. 공중 보건 영국.신종 SARS-CoV-2 변종 조사: 우려 변종 202012/01, 기술 브리핑 3. 영국 런던: Public Health England;2020. https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/950823/Variant_of_Concern_VOC_202012_01_Technical_Briefing_3_-_England.pdf
2. Kemp SA, Harvey WT, Datir RP 등SARS-CoV-2 스파이크 결실 ΔH69/V70의 반복적인 출현 및 전파.bioRxiv[2021년 1월 14일 온라인에 게시된 사전 인쇄].https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.14.422555v4
3. Volz E, Mishra S, Chand M 등.영국의 SARS-CoV-2 혈통 B.1.1.7 전파: 역학 및 유전 데이터 연결을 통한 통찰력.medRxiv [2021년 1월 4일 온라인에 게시된 사전 인쇄].https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.30.20249034v2
4. Honein MA, Christie A, Rose DA 등;CDC COVID-19 대응팀.높은 수준의 SARS-CoV-2 지역사회 전파 및 관련 사망 문제를 해결하기 위한 공중 보건 전략 지침 요약, 2020년 12월. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2020;69:1860–7.PMID:33301434
5. Volz E, Hill V, McCrone JT 등;COG-UK 컨소시엄.SARS-CoV-2 스파이크 돌연변이 D614G가 전염성과 병원성에 미치는 영향 평가.셀 2021;184:64–75.e11.PMID:33275900 https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.11.020
6. Korber B, Fischer WM, Gnanakaran S, 외.Sheffield COVID-19 유전체학 그룹.SARS-CoV-2 급증의 변화 추적: D614G가 COVID-19 바이러스의 감염성을 증가시킨다는 증거.셀
2020;182:812–27.PMID:32697968 https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.043
7. McCarthy KR, Rennick LJ, Namnulli S 등.SARS-CoV-2 스파이크 당단백질 구동 항체 탈출의 자연적 결실.bioRxiv [2020년 11월 19일 온라인에 게시된 프리프린트].https://www.biorxiv.org/content/
10.1101/2020.11.19.389916v18.SARS-CoV-2 검사에서 Washington NL, White S, Schiabor KM, Cirulli ET, Bolze A, Lu JT.S 유전자 탈락 패턴은 미국에서 H69del/V70del 돌연변이의 확산을 시사합니다.medRxiv [2020년 12월 30일 온라인에 게시된 사전 인쇄].https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.24.20248814v1
9. Weisblum Y, Schmidt F, Zhang F 등.SARS-CoV-2 스파이크 단백질 변이체에 의한 중화 항체로부터 탈출하십시오.eLife 2020;9:e61312.PMID:33112236 https://doi.org/10.7554/eLife.61312
10. Greaney AJ, Loes AN, Crawford KHD 등다클론 인간 혈청 항체의 인식에 영향을 미치는 SARS-CoV-2 수용체 결합 도메인에 대한 돌연변이의 포괄적인 매핑.bioRxiv [2021년 1월 4일 온라인에 게시된 사전 인쇄].https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.31.425021v1


게시 시간: 2021년 2월 11일